La endodoncia es un tratamiento invasivo a la pulpa del diente. Cuando la caries que se presentaba en la superficie del diente invade la zona interna del diente puede producir dolor e inflamación, lo que en ocasiones conocemos como «flemón». En esa situación lo que se procura es limpiar la infección en la parte interna del diente mediante la eliminación de los restos con unas limas y el sellado de los conductos con una masa plástica para que los microbios no puedan pasar hacia el interior del hueso. Es un tratamiento que trata de prolongar unos años más la vida natural del diente.